Cảng Sài Gòn là chủ nhân của chiếc Cúp quốc gia đầu tiên vào năm 1992 sau khi thắng Thể Công trong loạt sút luân lưu ở sân Thống Nhất. Cũng tại đây, Cảng Sài Gòn còn giành chiếc Cup này một lần nữa vào năm 2000.

Trong lịch sử 27 năm của Cúp Quốc gia (từ năm 1992 đến 2019), có tổng cộng 16 nhà vô địch giải đấu. Đó là Cảng Sài Gòn, SHB Đà Nẵng, Bình Định, Công an Hồ Chí Minh, Hải Phòng, Hải Quan (2 lần), Đồng Tâm Long An, Bóng đá Hà Nội, Nam Định, Sài Gòn Xuân Thành, Hòa Phát Hà Nội, Navibank Sài Gòn, Hà Nội và Ninh Bình (1 lần) và đội có thành tích tốt nhất đó là Sông Lam Nghệ An và Becamex Bình Dương (3 lần).